研究人员近日开发出一种全基因组范围的测序分析，可定位DNA切除修复。

当紫外线或其他一些物质造成基因组损伤时，此位点的一些DNA片段被切下，随后与TFIIH蛋白结合。利用与酶结合的抗体，研究人员能够分离出DNA片段-蛋白质复合物，并将它们拉出细胞，进行测序。然后研究人员能够将片段定位回基因组中，显示DNA修复发生在哪个位置。

据研究人员介绍，对于细胞中两种类型的UV诱导损伤：环丁烷嘧啶二聚体和嘧啶-嘧啶酮光产物，XR-seq能够产生核苷酸分辨率的修复图谱。他们发现，在野生型细胞中，CPD修复是与转录高度相关的，特别是模板链。

研究表明，细胞中不编码蛋白质的DNA调控区域也被修复。此外，研究人员表示，这种分析也能发现癌细胞中修复DNA损伤的特定机制。如今，DNA损伤修复的研究已成为热点。

研究介绍了利用测序方法来检测DNA中的双链断裂，包括基因组编辑的核酸酶所产生的。这种被称为GUIDE-seq的方法利用一种短双链寡核苷酸来标记CRISPR-Cas诱导的脱靶断裂，测序这些标签所在的基因组区域，就能够确定脱靶突变的位置。