因为制药用水系统的取样频率是在系统验证数据的基础上确立的，因此，取样点应覆盖所有的关键区域，包括水处理设备的操作位置，水处理设备取样点的取样频率可以低于使用点。
取样时，所有取样品应具有代表性。取样器具应事*行消毒，收集样品前，充分冲洗。含有化学消毒剂的样品在中和后方可进行微生物学分析，用于微生物学分析的样品均应处于保护之中，在取样后或者立刻进行微生物检测，或者存放至测试开始以前。
(1)取样点的布置和取样频率
①在通常情况下，送回水管每天取样1次；
②使用点可轮流取样，但需要保证每个用水点每月不少于1次。
(2)水质测试指标和合格标准
①化学指标 符合美国药典USP3.7标准和中国药典2015版标准。
②微生物指标 纯化水不大于100CFU/ml；注射用水不大于10CFU/100ml。
③细菌内毒素指标 纯化水的细菌内毒素的指标应符合纯化水企业内控标准，注射用水应小于0.25EU/ml。
(3)重新取样检测
①对不合格的使用点，再取样1次；
②重新化验不合格的指标
③重测这个指标，必须合格
6