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PCR反应条件如何配置

2024-11-4  阅读(204)

       PCR反应条件为温度、时间和循环次数。

  温度与时间的设置:基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三温度点。在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性,再迅速冷却至40 ~60℃,引物退火并结合到靶序列上,然后快速升温至70~75℃,在Taq DNA 聚合酶的作用下,使引物链沿模板延伸。对于较短靶基因(长度为100~300bp时)可采用二温度点法,除变性温度外、退火与延伸温度可合二为一,一般采用94℃变性,65℃左右退火与延伸(此温度Taq DNA酶仍有较高的催化活性)。PCR反应条件配置如下:

1.  PCR反应的缓冲液提供合适的酸碱度与某些离子 。

2.  镁离子浓度总量应比dNTPs的浓度高,常用1.5 mmol/L。

3.  底物浓度dNTP以等摩尔浓度配制,20~200 umol/L。

4.  TaqDNA聚合酶2.5U(100 ul)。 

5.  引物 浓度一般为0.1 ~0.5 umol/L。 

6.  反应温度

(1)变性温度和时间95℃,30 s。

(2)退火温度和时间 低于引物Tm值5 ℃左右,一般在45~55℃。

(3)延伸温度和时间72℃,1 min/kb(10 kb内)。

(4)Tm值=4(G+C) +2(A+T)。

7.  循环次数

一般为25 ~30次。循环数决定PCR扩增的产量。模板初始浓度低,可增加循环数以便达到有效的 扩增量。但循环数并不是可以无限增加的。一般循环数为30个左右,循环数超过30个以后,DNA聚合酶活性逐渐达到饱和,产物的量不再随循环数的增加而增加,出现了所谓的“平台期"。

 

 




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