餐厨垃圾、菜场果蔬垃圾和蔬菜基地果蔬垃圾分别经由密闭运输车辆输送至处理站，直接卸入卸料/分拣平台，经人工分选将其中的塑料和纸质包装类垃圾以及少量玻璃瓶、金属物料、砖瓦等无机物料分选出来后，进入破碎机破碎至1-3cm一下，然后进入螺旋挤压脱水机进行脱水处理，脱除下来的渗滤液进入油水分离，经过处理排入污水管道。挤压产生的含固率在40%以上的干物料经由皮带输送机送入高温好氧发酵仓内进行高温好氧发酵处理。
物料在高温好氧发酵仓内，通过强制通风与内部搅拌翻堆相结合的方式，保证氧气充分供给，以使物料中的挥发性有机质降解效率达到70%以上，确保处理后产物充分腐熟，以使物料中的寄生虫(卵)、病原菌，病毒等充分灭活，高温好氧发酵仓出料经由出料口排出。高温好氧发酵仓内产生的高湿、高温和高污染恶臭气体，排入气体净化箱进行净化。
在设备内预先投入的菌种，通过搅拌混合及适当的温度提供菌种适合繁殖的条件，在细菌繁殖的过程中将餐厨垃圾中的脂肪、蛋白质、淀粉等物质分解成水和二氧化碳，之后只剩下较少数残渣的这一过程，就是餐厨垃圾的处理过程。
