餐厨垃圾通过预处理之后，相对纯净的餐厨垃圾废弃油脂会经过再加工。常见的生产工艺可分为五种:
一、碱催化酯交换反应
该反应具有速率快、转化率高等优点，是目前生物柴油生产比较常见的方法之一。在均相碱催化剂中以甲醇盐应用较为广泛，因为甲醇盐作为催化剂，操作容易、价格低、活性高、反应时间短、反应所需温度低、催化剂用量少，且反应后通过中和水容易去除。
二、酸催化酯交换反应
该过程一般使用硫酸、盐酸、磷酸、有机硫磺、固体*酸等进行催化。通常采用两步法处理：首先先用酸催化酯反应，待酸值降到一定程度后，干燥除水，再进行第二步的碱催化转酯化反应。缺点是在生产中会造成生物柴油分离困难，并产生酸性废水
三、脂肪酶催化酯交换反应
以脂肪酶为催化剂，动植物油与醇发生酯交换反应生成脂肪酸酯的过程。酶催化法是以脂肪酶为催化剂，动植物油脂与醇发生酯交换反应生成脂肪酸酯的过程。酶催化法存在制备工艺简单、原料适用性广、反应条件温和、醇用量小、产物易回收、不腐蚀设备、不污染环境等优点。但脂肪酶作为催化剂还有一定局限性，底物降低酶的活性，对其有抑制作用；酶的价格昂贵，寿命短；脂肪酶在有机溶剂中不易分散，存在聚集作用，催化效率较低，直接造成生产成本居高不下。
四、超临界甲醇流体法
超临界甲醇流体法就是处于超临界状态下的甲醇与动植物的油脂发生酯交换反应生成脂肪酸甲酯的工艺。相比于传统的酸、碱催化法和酶催化法等技术，超临界酯交换反应不需要催化剂，反应速率快和产物分离简单，具有明显优势；但仍然存在反应温度、压力条件不够温和，对设备要求较高及操作费用高等缺点。
五、加氢工艺法
与酯交换工艺相比，加氢工艺具有原料适应性强，可利用现有炼厂加氢技术与设备直接加氢脱氧，工艺比较简单，产物具有高的十六烷值等优点，同时加氢工艺得到的绿色柴油是优质的柴油调和组分，沸程范围接近典型的石化柴油，但得到的柴油组分中主要是长链的正构烷烃，使得产品的浊点较高，低温流动性差，产品在高纬度地区环境下使用受到抑制，一般只能作为高十六烷值柴油添加组分。
加强餐厨垃圾收运管理可以采用引导、统一管理、集中收运、定点处置、社会参与、市场化运作等手段。采取灵活策略应结合实际，规范餐厨垃圾的收运、处理。餐厨垃圾特别是废食用油脂资源的合理化利用，对防止废食用油脂再次进入食物链和促进生物柴油的发展都十分有利。
