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货号 | XG-P2955 | 规格 | 100Tx20μl |
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包装 | 盒装 | 用途 | 仅供科研研究实验 |
Bst 4.0 Basic Mix (液体预混)
货号 | 规格 | 分类 |
XG-P2955 | 100Tx20μl | 恒温扩增系列 |
该制品为单一组分的 MasterMix(2 倍浓度),包含了反应缓冲液、Mg2+、dNTP、Bst 4.0 DNA/RNA 聚合酶等,使用时只需要加入引物、模板即可进行核酸恒温扩增。Bst4.0 DNA/RNA 聚合酶具有依赖于 RNA 模板的聚合酶活性(逆转录),还具有依赖于 DNA 的聚合酶活性,因此无论DNA 或 RNA 样本均可使用该制品进行高效的恒温扩增。该制品是进行 LAMP 及 RT-LAMP 扩增反应的试剂。优化的反应体系,确保快速的完成检测试剂的反应体系建立。该系列产品不包含任何其它辅助染料,在 LAMP 的扩增搭配 OG 橙绿变色管进行可视化变色反应。除此外,该制品还可以用于其它恒温扩增实验,包括 CPA、SMAP 等。
储存:长期保存制品于-20℃,保存 2 年。
使用实例(以 LAMP OG 橙绿变色为例)橙绿变色染料(OG Dye)以冻干的形式预加在 8 联管盖上。在 LAMP 反应完毕后(在反应完毕前,务
必不能将管盖上染料混入反应液中),将 0.2ml EP 管颠倒溶解 OG 染料后。LAMP 的反应产物将与 OG 染料形成强烈的绿色肉眼可见变色反应(阳性),而未发生扩增的 EP管为深橙色(阴性)。
(1)配制反应体系
在 0.2ml EP 反应管中加入下述试剂
2xBst 4.0 Basic Mix 10 μl
*10xLAMP Primer Mix 2 μl
模板 DNA/RNA X μl
ddH2O 到总体积 20 μl
*10xLAMP Primer Mix 浓度:FIP/BIP 分别为 16 μM、LoopF/B 分别为 4 μM、F3/B3 分别为 2 μM全部试剂加入完毕后,轻弹 EP 管底部后,再盖上 OG 橙绿变色管(盖上管盖后务必不能再剧烈混合与倒置,以防止将管盖上的 OG 染料溶解,OG 染料一旦混入反应液中将会终止 LAMP 反应)。
实验 LAMP Primer Mix 分别采用 1、1.5、2 μl,以阴性不变色,阳性样品正常变色为标准,作为后续测试用量。
(2)反应体系配好后,置于 60~68°C(实验采用65°C)进行反应 20~45min。(扩增良好的引物组合,通常 25min 即可变色,一般不超过 45min,实验设置20、25、30、45min)。
(3)观察结果:观察结果时,尽可能不要与配制反应空间共用,以防止污染操作台。将反应 EP 管倒置,并手腕轻甩,反应液浸泡 EP 管盖上的 OG 染料,静置 30s。再将 EP 反应管正置,并轻甩反应液到 EP 管底部,此时扩增样品将变为鲜艳肉眼可见绿色,而阴性未发生扩增的管将为深橙色。
注意事项
1. 在用于其它恒温扩增反应时(如 CPA、SMAP 等),可参考如上策略进行使用,反应时间可能会需要调整。
2. 关于矿物油的使用,在配制完 LAMP 反应体系后,可加入一滴矿物油覆盖于反应液上部,以减少气溶胶的污染。
3. 鉴于特殊的生产工艺, 全系恒温扩增 Mix 系
列均不能进行浊度分析。
一、模板DNA:PCR反应需要模板DNA,如从细胞、组织、血液中提取DNA等;
二、引物:PCR反应的两个引物,分别与模板DNA的两端配对扩增所需的特定区域,引物也可以合成为TA克隆等过程中使用到的引物;
三、dNTPs:PCR反应中需要四种dNTPs,包括脱氧腺苷酸(dATP)、脱氧胸苷酸(dCTP)、脱氧鸟苷酸(dGTP)、脱氧胞嘧啶酸(dTTP),用于细胞分裂、DNA合成 等生物学过程,用于PCR扩增的模板DNA链的延伸和扩增;
四、Taq DNA聚合酶:PCR反应需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,还有一些其他种类的聚合酶如PFU、Phusion等,用于扩增DNA链;
五、PCR buffer溶液:对PCR反应具有缓冲作用,调节反应pH,硫代硫酸氢盐SDS、小分子有机化合物如甲醛,可增强PCR反应特异性,从而提高反应效率;
六、酶切体系:PCR扩增往往涉及到重组、构建和测序等等实验步骤,常常需要进行酶切操作。
七、MARK:一种分子量标准,用来判别DNA片段大小的工具。
八、DNA纯化试剂盒:用于纯化PCR反应产物;
①Oligo dT
选择Oligo dT时,要求RNA必须有Poly A,所以真核生物的mRNA都适用。适合长链甚至全长mRNA的RT,对RNA样品的质量要求较高,不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。假如想探索新的mRNA进行RT反应,建议推荐使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比随机引物和特异性引物的稳定性要好。
②随机引物
适合各种RNA的RT,尤其适合模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量很低)。选择随机引物时,链cDNA合成反应中就是以所有的RNA为模板,然后进行PCR反应时设计引物进行特异性扩增。同时要注意随机引物的量和总RNA量之间的关系,一般建议每5µg总RNA的随机引物的用量为50ng,如果每5µg总RNA的随机引物的用量超过250ng,可能会导致小片段产物(<500bp)的增加和长片段、全长产物的降低。
③特异性引物
基因特异性引物(GSP)是某个基因序列的一部分,与模板互补的引物。该引物需要结合目标RNA的已知序列进行设计。由于引物和RNA序列特异性结合,每个目标RNA都需要一套新的基因特异性引物。因此,当分析多种目标时,则需要适用更多的RNA样本。而且不同引物退火温度本来就不相同,所以一般不推荐使用。如需要使用特异性引物,建议对退火温度进行优化。
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