全自动氮吹仪操作过程主要包括有样品提取（萃取）、浓缩、净化及再浓缩等基本步骤。
全自动氮吹仪可以用以下方式进行清洗维护
1、加热介质：使用蒸馏水和去离子水，这将防止在水浴壁上产生水垢。注意不要使用有机溶剂作加热介质。
2、除藻剂：不加热时，在水浴的水中加以除藻剂，可防止生物污染。不应使用酸性除藻剂，并应确保所用除藻剂不会影响所要处理的样品。
3、换水：水浴中的水建议一周一换，长不超过一月。
4、酸性环境：当接触或暴露于酸性材料、蒸汽或样品后，应当立刻清洗，用适度的溶液或其它相似溶液中和，再用清水冲洗。长时间接触酸性物质，将会损坏仪器。如必须长时间接触酸性物质，则应采取保护措施。
5、针头：每次使用完针后都应清洗，尽量减少针的污染。可使用有机溶剂冲洗、高压消毒和索氏提取等技术。
6、浸没：浴底耐水但不防水。绝不能将水浴浸泡在任何液体中，或放置在可能发生浸泡的地方。
全自动氮吹仪常见故障及排除
故障情况：原因及排除
显示正常但不加热：设定温度低于测量温度。
加热灯亮但不升温：1、输出端连接故障，或加热工作器件故障
2、控制板和电源板之间连接故障
一直显示0.0：热敏电阻短路或温度过下限
一直显示99.9：热敏电阻开路，没连接好，或温度过上限
温度过冲较大：1、P值太大，适当调小
2、温度探头太靠近加热原器件
升温速度很慢：1、P值太小，适当调大
2、加热器件功率太小或温度探头太远
温度波动不稳定：P值偏大或C值太小
温度反映迟钝：C值偏大，适当调低C值
显示温度误差较大：温度探头故障或探头位置不正确
显示温度小幅误差：系统有误差，调整SC值
