在洁净室建设或改建时，不能依赖于竣工验收来保证洁净室的质量，必须从设计及设备选型阶段就严格把关，在建设的全过程中对主要关键点严格检查、监督，在实际使用中定期监测才能保证洁净室达到设计指标和使用要求。

无菌科研是任何标明“无菌"的科研，生产洁净室是保证无菌科研质量的基本条件，控制无菌科研生产过程的环境并规范其生产，防止环境对无菌科研污染，洁净室必须满足规定环境参数的要求来建设和定期监测。

温度和相对湿度无菌科研在无特殊规定时，通常要求温度在法规标准检测Standard and Testing18~28 C，湿度在45%~65%，企业一般都可以控制在要求内。如在动态监测中发现达不到要求，可能是室内有产热大的仪器设备。

风量、换气次数、静压差在洁净室体积确定的情况下，换气次数由该室的送风量决定，而静压差取决于房间的送风量与回风量、排风量的差值。系统总送风量、新风量、总排风量和对外压差可以通过调整风机频率转速或总阀门开启度来实现，各房间的风量和压力则可通过调整分支管路阀门开度来实现。