1 简介
噬菌体展示的出现，对发现多肽配体，以及简化和优化蛋白质的结构和功能十分有效。噬菌体展示筛选有两个基本的组成部分：靶标大分子和噬菌体。噬菌体是作为一种支架来展示多肽的重组文库的，并且可以用来释放和扩增结合在靶标大分子上的多肽。通常，靶标大分子是蛋白质，但也可以是核酸、糖类和磷脂，并且可以根据其纯度广泛地分为简单的或复杂的靶标。固定在固相基质上的纯蛋白（如抗体）是一个简单的靶标，而细胞表面则是一个复杂的靶标。
2 体内及体外的噬菌体展示
本实验室于1996年报道了噬菌体展示被成功用于体内实验，并描述了与鼠脑或肾的脉管系统特异性结合的几段多肽。体内噬菌体展示包括静脉注射噬菌体文库，释放与不同器官和组织的脉管系统结合的噬菌体，接着扩增以及纯化，然后重新注射一个噬菌体文库，来富集能针对特异性的器官和组织的克隆。体内筛选的一个特征就是可以同时进行正筛选和负筛选，这是由于器官和组织的脉管系统之间彼此存在着差异，而且在空间上也是分开的。当特异性噬菌体在靶标器官上被富集起来时，除靶标以外与器官和组织的脉管系统特异性结合的噬菌体被洗脱下来。
体外噬菌体展示描述的是将噬菌体溶液添加到器官和组织的原代细胞悬液中。体内和体外噬菌体展示之间的一个显著差异是：在体内方法中噬菌体首先暴露于血管内皮细胞，而在体外时则是暴露于所有类型的细胞。
zui后，我们提到了在培养细胞上所进行的筛选，以及在体内噬菌体展示中大分子的粗提和纯化。
我们采用体外筛选来作为预筛选及筛选的方法，但zui初的用途是测试从体内筛选中发现的个别噬菌体。体外噬菌体展示是一种高通量的方法，这使得在一只小鼠上取材，来筛选许多不同的噬菌体成为可能。我们发现体外噬菌体展示比体内噬菌体展示具有更低的本底，即在体内与器官和组织脉管系统结合的噬菌体，在体外具有更高的亲和力，换句话说就是体外的结合比体内定位（homing）具有更高的特异性。体外具有较高的亲和力是由于器官和它的脉管系统都表达受体，定位于肺的GFE—1多肽及其受体——膜二肽酶（membrane dipeptidase）就是一个例子L14）。然而，体外噬菌体展示也能探测与少数细胞群体结合的多肽。
3 噬菌体载体
我们所采用的载体是George Smith的源自fd-tet的fUSE5噬菌体载体和Novagen的T7Selecte载体。这两种噬菌体的大小、形态和生长周期都有所不同。fd是一种具有温和生长周期的丝状噬菌体，而T7有一个二十面体衣壳，并且是一种溶解性噬菌体。具有裂解系统的筛选技术要更加快速，并且制备有绑定能力的载体也具有商业可行性。fUSE5以5个拷贝数（也就是多价的）展示作为融合在fd的基因Ⅲ蛋白（pⅢ蛋白）N端的融合蛋白的多肽。Novagen的T7载体展示有1～415个插入序列的拷贝，相当于作为C端与基因10蛋白融合的约1200个氨基酸。我们利用T7Select415—1b、T7Selectl0—3b和T7Selectt—1b来作为我们多肽文库的载体，并用T7Selectl0—3b和T7Selectl—1b载体来展示更大的蛋白质和cDNA文库。