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注意:当在组织培养板中进行不同剂量的siRNA转染时,转染试剂和siRNA转染培养基的用量需要与不同孔的表面积成比率。
1,准备以下混合物:
(A)加1.8ul的10um siRNA到20ul 的siRNA转染培养基中,轻柔混合,在室温放置5分钟 注意:如果需要低浓度的siRNA,用siRNA稀释缓冲液稀释
(B) 加1.2ul siRNA转染试剂到20ul siRNA转染培养基中,轻柔混合,室温放置5分钟。注意:虽然,对多种的细胞系有很高的转染效率,但siRAN转染试剂并不是对所有细胞都适合。
2,5分钟后,混合A和B,形成siRNA-siRNA转染试剂复合物,轻柔混合,室温孵育20分钟。
3,孵育后,加160ul siRNA转染培养基到每个含有siRNA-siRNA转染试剂复合物的管中,轻柔混合
从这一步起,对悬浮细胞和贴壁细胞的处理方法相同
4,转染前,吸弃培养基,用0.3ml无菌siRNA转染培养基洗细胞一次,去除培养基。
5,在洗过的细胞上,铺稀释的siRNA-siRNA转染试剂混合物,37度,5-7小时
6,孵育后,向含有转染细胞的每个孔中加200ul 生长培养基,其中的血清和抗生素浓度是正常浓度的两倍,无需去除转染混合物。如果,毒性是个问题的话,去除转染混合物,以正常生长培养基代替。再孵育18-24小时
7,孵育结束后,用新鲜正常生长培养基替换,继续孵育24-72小时
8,使用恰当的操作步骤检测细胞,参见免疫荧光染色步骤
染色质免疫沉淀间隙连接蛋白45抗体说明书,CX45抗体价格
注意:CHIP的实验步骤可以有很多不同版本,下面介绍的步骤适合大多数的实验
常温下,用PBS洗细胞,重悬细胞,使细胞数大约5*105个/ml(总细胞数2*107)。,
加甲醛,使终浓度为1%,室温孵育10分钟。
加*至终浓度
2000rpm,5分钟,离心细胞。用冷的PBS洗细胞一次
用6ml的裂解缓冲液重悬细胞,轻柔混合,2000rpm离心5分钟,收集粗提的核提取物。
再用PBS洗沉淀,沉淀可以冻存,或继续以下步骤。
用1.9ml的高盐裂解缓冲液重悬沉淀,转移到2ml的离心管中准备超声
超声条件需要优化,下面介绍的条件是在使用Sonics VC130和
在冰上操作,输出功率设置5(R)6,每隔30秒超声一次,共4次。
4°C,10,000rpm 离心15分钟,保存上清,确定上清中蛋白的浓度。
如果免疫沉淀,我们推荐100—500ug蛋白和0.1—1ul的TransCruz试剂(0.2—2ug)
注意:研究者可能希望使用连接有葡聚糖或磁珠的一抗,以便于选择后续免疫沉淀的试剂。有些情况下,将针对同一种蛋白不同表位的抗体联合使用会更好。
向染色质溶液加50ul Protein A/G-琼脂糖,4度,孵育30分钟,使其澄清,zui大速度,4度离心5分钟。
向上清中加一抗,4度孵育过夜。
加50ul Protein A/G –琼脂糖,4度孵育2小时。
12,000rpm离心20秒收获磁珠,并将管放在冰上
用1ml裂解缓冲液洗磁珠2次
用冲洗缓冲液洗磁珠四次
重悬磁珠在400ul洗脱缓冲液中
通过在67度水浴中孵育管子2小时以上,使反向交叉连接
离心去除磁珠,继续在67度水浴孵育上清过夜 Remove
10,000rpm离心3分钟去除残留的珠子,保留上清
分离DNA,用500ul 酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)抽提上清,剧烈振荡,14,000rpm离心3分钟分离两相。
保留水相,用100ul
用600ul 氯仿/异戊醇抽提汇集的水相
DNA可以用商业化的试剂盒浓缩。
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