当前位置:上海金穗生物科技有限公司>>公司动态>>用突变的VlCDR3构建SCFv基因文库
[方法]
1.设计合成含有CDR3随机化序列的VLFOR引物。当然,此引物必须以拟进行亲和力成熟的抗体VL基因作为基础进行设计。本例中,VLCDR3的7个氨基酸被随机化。在每个随机化位点中,保留了大约50%野生型氨基酸。引物设计结果如下:
VLFOR随机引物: 5’—CCC TCC GCC GAA CAC CCA ACC 524 513 524 524 542 541 511 CTG GCA GTA ATA ATC AGC CTC—3’
数字对应摩尔分数如下。
(1)A(70%)、C(10%)、G(10%)、T(10%)。
(2)A(10%)、C(70%)、G(10%)、T(10%)。
(3)A(10%)、C(10%)、G(70%)、T(10%)。
(4)A(10%)、C(10%)、G(10%)、T(70%)。
(5)G(50%)、C(50%)。
利用分子建模去识别哪个CDR3残基具有溶剂可接近侧链,来确定随机化残基。
2.配制4个50w1 PCR反应混合液,包含:
● 去离子水,35.5ul
● 20XdNTP, 2.5ul
● 10XVent聚合酶缓冲液,5.0ul
● lMB3引物(10pmol/ul),2.5ul
● VI-FOR引物 (10pmol/ul), 2.5ul
● 野生型scFv基因模板DNA(100ng), 1.0ul
● VentDNA聚合酶(2单位),1.0ul
3.在有加热盖的热循环仪内加热混合液到94℃,5分钟。
4.以94℃1分钟、42℃1分钟、72℃2分钟的条件共循环30次,扩增VL基因。
5.在1%琼脂糖胶上胶纯化VL基因(接近800bp);用Geneclean试剂盒提取DNA。将
每种产物重悬于20ul水中。在1%琼脂糖凝胶上与已知大小和浓度的标准对照品比较,测定DNA浓度。
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